【文章摘要】社会-经济-自然系统是人类赖以生存和发展的复合系统，而数据驱动下的系统研究为加强生态系统的认知提供了新的增值导向。在新的数据语境下，社会-经济-自然复合系统呈现出一些新的特征，研究对象逐渐从单一要素向多要素耦合的方向转变，使支撑量化研究的数据体系更多样化、数据来源更广泛化、数据表达更具可视化，并呈现出研究尺度逐渐扩大化、研究对象更精细化的特征。在对数据的识别、表达和可视化的过程中，既要加强对时间、空间、结构、数量和秩序的耦合，也要注重与决策制定和地方服务的结合。新时期复合生态系统的未来研究方向应该从关键科问题及支撑技术、尺度作用和多要素耦合以及地方和全球治理的科技支撑等方面展开，在数据的不断革新下，加强对多源数据、长期监测和时间序列的认知仍是需要深入研究的课题。开展复合生态系统的数据驱动分析，不仅能为生态系统的服务及可持续发展提供技术支撑，增强数据的长效共享机制，同时可为实现决策制定和信息传播等方面提供更多的价值支持。